regmap_update_bits(imx6_pcie->iomuxc_gpr, IOMUXC_GPR1,
                        IMX6Q_GPR1_PCIE_TEST_PD, 1 << 18);
-       regmap_update_bits(imx6_pcie->iomuxc_gpr, IOMUXC_GPR12,
-                       IMX6Q_GPR12_PCIE_CTL_2, 1 << 10);
        regmap_update_bits(imx6_pcie->iomuxc_gpr, IOMUXC_GPR1,
                        IMX6Q_GPR1_PCIE_REF_CLK_EN, 0 << 16);
 
-       /* Some boards don't have PCIe reset GPIO. */
-       if (gpio_is_valid(imx6_pcie->reset_gpio)) {
-               gpio_set_value(imx6_pcie->reset_gpio, 0);
-               msleep(100);
-               gpio_set_value(imx6_pcie->reset_gpio, 1);
-       }
-
        return 0;
 }
 
        /* allow the clocks to stabilize */
        usleep_range(200, 500);
 
+       /* Some boards don't have PCIe reset GPIO. */
+       if (gpio_is_valid(imx6_pcie->reset_gpio)) {
+               gpio_set_value(imx6_pcie->reset_gpio, 0);
+               msleep(100);
+               gpio_set_value(imx6_pcie->reset_gpio, 1);
+       }
        return 0;
 
 err_pcie_axi: